Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXM1Q08050 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXM1Q08050 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms