Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms