Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms