Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms