Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF135P52742 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms