Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB28P51157 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB28P51157 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms