Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMPOP42166 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMPOP42166 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMPOP42166 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TMPOP42166 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TMPOP42166 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TMPOP42166 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms