Protein–RNA interactions for Protein: P41279

MAP3K8, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K8P41279 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP3K8P41279 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms