Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HPCAL1P37235 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms