Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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DUSP1P28562 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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DUSP1P28562 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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DUSP1P28562 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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DUSP1P28562 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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DUSP1P28562 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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DUSP1P28562 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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DUSP1P28562 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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DUSP1P28562 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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DUSP1P28562 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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DUSP1P28562 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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