Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PTPRBP23467 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PTPRBP23467 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PTPRBP23467 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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