Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMNB1P20700 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms