Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX4I1P13073 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms