Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms