Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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