Protein–RNA interactions for Protein: O75146

HIP1R, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1RO75146 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIP1RO75146 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms