Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDIL3O43854 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EDIL3O43854 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms