Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDB2O43679 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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LDB2O43679 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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LDB2O43679 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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LDB2O43679 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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LDB2O43679 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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LDB2O43679 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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LDB2O43679 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LDB2O43679 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LDB2O43679 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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