Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms