Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms