Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-7A0A0A0MS04 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-7A0A0A0MS04 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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