Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
MAP3K4Q9Y6R4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
MAP3K4Q9Y6R4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms