Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N3

CLCA3P, Calcium-activated chloride channel regulator family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA3PQ9Y6N3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA3PQ9Y6N3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCA3PQ9Y6N3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCA3PQ9Y6N3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms