Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GJA3Q9Y6H8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GJA3Q9Y6H8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJA3Q9Y6H8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms