Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Z0

BACE2, Beta-secretase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE2Q9Y5Z0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BACE2Q9Y5Z0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BACE2Q9Y5Z0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BACE2Q9Y5Z0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms