Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX5Q9Y5X3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms