Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4S1Q9Y587 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4S1Q9Y587 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4S1Q9Y587 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms