Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FARP1Q9Y4F1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FARP1Q9Y4F1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARP1Q9Y4F1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms