Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
R3HCC1Q9Y3T6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
R3HCC1Q9Y3T6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HCC1Q9Y3T6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HCC1Q9Y3T6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms