Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K5

R3HDM2, R3H domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM2Q9Y2K5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HDM2Q9Y2K5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
R3HDM2Q9Y2K5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 823.5 ms