Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP11BQ9Y2G3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP11BQ9Y2G3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11BQ9Y2G3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms