Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms