Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
HDAC5Q9UQL6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms