Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms