Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS0

NFU1, NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFU1Q9UMS0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFU1Q9UMS0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms