Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EPDR1Q9UM22 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPDR1Q9UM22 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms