Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO1Q9UM00 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO1Q9UM00 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO1Q9UM00 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO1Q9UM00 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO1Q9UM00 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMCO1Q9UM00 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms