Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRFN2Q9ULH4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRFN2Q9ULH4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRFN2Q9ULH4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRFN2Q9ULH4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRFN2Q9ULH4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRFN2Q9ULH4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRFN2Q9ULH4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRFN2Q9ULH4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRFN2Q9ULH4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRFN2Q9ULH4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRFN2Q9ULH4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRFN2Q9ULH4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms