Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KCNH3Q9ULD8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KCNH3Q9ULD8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms