Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARRES3Q9UL19 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARRES3Q9UL19 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARRES3Q9UL19 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms