Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP45Q9UL16 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms