Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT11Q9UKZ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT11Q9UKZ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms