Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CROTQ9UKG9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms