Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GGA1Q9UJY5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GGA1Q9UJY5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GGA1Q9UJY5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms