Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC23Q9UJX2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC23Q9UJX2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC23Q9UJX2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC23Q9UJX2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.5 ms