Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HACL1Q9UJ83 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HACL1Q9UJ83 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HACL1Q9UJ83 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HACL1Q9UJ83 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms