Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNOT7Q9UIV1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNOT7Q9UIV1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CNOT7Q9UIV1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms