Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLCO3A1Q9UIG8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO3A1Q9UIG8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms