Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP25Q9UHP3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP25Q9UHP3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms