Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms